مرحوم امانی، سال ۱۳۸۷ در یک حادثه تصادف درگذشت. بسیاری از فعالین حرکت ملی مرگ وی و دیگر فعالینی که در آن برهه دچار حادثه شده و فوت کردند را مشکوک می‌دانند و معتقدند وزارت اطلاعات در این حوادث دست داشته است.